История томской милиции тесно связана с историей Томской области. В 1944 году, когда Указом Президиума Верховного Совета СССР была образована Томская область, стали формироваться необходимые структуры управления. В УНКВД были созданы отделы уголовного розыска, тюремный, пожарной охраны, спецпоселений и другие. И везде требовались кадры. За счет органов НКВД Томска, Нарымского окружного отдела и откомандированных из Новосибирска удалось укомплектовать лишь половину штата. Областной комитет ВКП(б) направил по партийной линии в милицию десятки коммунистов и комсомольцев, но многие из них вскоре уволились. Оставались самые стойкие. В первой половине 1950-х годов часто менялось руководство милиции.

В 60-80-е годы XX века первые руководители оставались на своих постах более продолжительное время. В этот период вырос образовательный уровень сотрудников. Если раньше начальники областного управления с законченным высшим образованием являлись исключением, то после 1966 года все томские руководители милиции имели вузовские дипломы. На должности рядового и сержантского состава принимались люди с образованием не ниже семилетнего, а с начала 1980-х годов не ниже среднего.

В начале 1960-х годов профилактика преступлений стала одной из задач органов правопорядка. Усилилась борьба против алкоголизма, милиция стала активно сотрудничать с общественностью. К 1982 году в Томской области насчитывалось 166 общественных пунктов охраны порядка, 48 тысяч членов народных дружин, в трудовых коллективах было 440 тысяч советов профилактики правонарушений. Криминогенная обстановка находилась под контролем милиции.

В начале 1990-х в области резко увеличилось количество краж, грабежей, угонов автотранспорта и тяжких преступлений. Появилась организованная преступность, стали совершаться заказные убийства, в ход пошло огнестрельное оружие, распространилась наркомания. В милицейской структуре тоже появились симптомы неблагополучия. Увеличение нагрузки и недостаточное материально-техническое обеспечение привели к оттоку профессионалов. Случались нарушения законности и дисциплины среди сотрудников милиции.

В это время в Томск выезжала специальная комиссия МВД России и выявила серьезные недостатки. Руководство УВД энергично взялось за решение накопившихся проблем. Больше внимания стало уделяться укреплению профессионального ядра ведущих служб УВД, были улучшены бытовые условия сотрудников. В 1996 году было создано специальное подразделение для борьбы с нарушителями дисциплины и законности среди сотрудников милиции. Улучшились взаимоотношения ОВД с государственными и общественными структурами. Разработана и принята областная программа борьбы с наркоманией. В июне 1999 года постановлением главы администрации утверждена областная программа борьбы с преступностью на 1999-2000 годы. При финансовой поддержке областной и городской администраций возведены новое здание Октябрьского ОВД города Томска, первая очередь 140-квартирного жилого дома УВД, реконструирована дежурная часть УВД, приобретены десятки автомобилей и спецтехника.

В 1998 году начальником УВД был назначен полковник милиции Виктор Оттович Гречман. Под его руководством УВД пришлось решать, в первую очередь, финансовые проблемы. В период возобновления военных действий на Северном Кавказе деятельность томских милиционеров была высоко оценена правительством и руководством МВД. 27 сотрудников ОМОН и ОМСН награждены орденами Мужества. Медалью "За отвагу" отмечены 169 сотрудников, медаль ордена "За заслуги перед Отечеством" II степени получили 45 человек и четверо медаль ордена "За заслуги перед Отечеством" I степени. 87 сотрудников награждены медалью "За отличие в охране общественного порядка". Председатель правительства Чеченской Республики С.В. Ильясов направил в МВД просьбу "закрепить функции обеспечения безопасности в Моздоке за сводным отрядом милиции УВД Томской области на постоянной основе".

Во второй половине 1990-х в Томске начался передел сфер влияния. Процесс раздела рынков и алкогольной сферы сопровождался стрельбой, взрывами, убийствами. В ноябре 2001 года произошло убийство шестерых членов этнической группировки, виновные были осуждены.

Непросто происходило обретение стабильности, но 1999 год УВД встретило под новым знаменем, врученным министром внутренних дел генерал-майору милиции В.О. Гречману как признание заслуг томской милиции.

В 2000-е годы УВД Томской области технически перевооружилось: обновлен парк компьютеров, внедрены технические новинки, созданы новые службы и подразделения. Проведен капитальный ремонт биохимической лаборатории ЭКЦ УВД, административных зданий 16 отделов внутренних дел области и трех городских райотделов, поликлиники УВД. Реконструированы общежития для сотрудников, возведено здание Кривошеинского РОВД.

В первой декаде XXI века эта тенденция продолжена: в Томск поступили образцы новейшей спецтехники – бронированный автомобиль «Тигр» и водометная установка «Шторм», несколько моторных лодок, обновлен парк автомобилей; после капитального ремонта открыто административное здание Спецприемника для содержания лиц, арестованных в административном порядке, проведен капитальный ремонт в дежурной части УВД по городу Томску, оснащенной новейшим оборудованием, в городе Колпашево открыто новое здание РОВД.        

В 2010 году управление внутренних дел по Томской области возглавил генерал-майор милиции Игорь Анатольевич Митрофанов, который продолжил модернизацию томской милиции. Этот процесс совпал с унификацией структуры МВД России. 1 марта 2011 года вступил в силу Федеральный закон «О полиции», призванный изменить работу правоохранительной системы в сторону большей открытости для граждан. По инициативе Президента РФ Д.А. Медведева органам правопорядка России вернули традиционное название профессиональной правоохранительной структуры – полиция.

Реформа МВД России явилась важнейшим шагом модернизации страны и системы государственного управления, становления современной правоохранительной структуры полицейского типа, главная цель которой – кардинальное изменение социальной роли органов внутренних дел в обществе, предусматривающее постепенное вытеснение карательной функции.

Сегодня органы внутренних дел Томской области уверенно идут к новой модели правоохранительной структуры, где полицейский, как сказал в интервью «Российской газете» Министр внутренних дел РФ Р.Г. Нургалиев, это «профессионал с высокими морально-нравственными качествами, готовый в любую минуту незамедлительно прийти на помощь». «Без широкого взаимодействия с гражданским обществом сегодня невозможно эффективно защищать права человека, охранять общественный порядок, обеспечивать национальную безопасность страны, - считает начальника управления Министерства внутренних дел Российской Федерации по Томской области генерал-майор полиции Игорь Митрофанов, - Возрождение доверия общества к системе органов внутренних дел - приоритетная задача томской полиции».

Руководство и личный состав УМВД России по Томской области с оптимизмом смотрит в будущее российской полиции, ориентированной на установление партнерской модели взаимоотношений между гражданами и органами внутренних дел.